Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 UROD-204ENST00000460334 663 ntTSL 510.36□□□□□ -0.756e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 CHD8-210ENST00000555962 1232 ntTSL 59.87□□□□□ -0.836e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 SUPT5H-211ENST00000598459 548 ntTSL 59.7□□□□□ -0.866e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ZNF207-204ENST00000394673 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.946e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 XIAP-201ENST00000355640 8584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.946e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ZNF207-202ENST00000342555 1905 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.976e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -16e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.046e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ZNF207-207ENST00000577908 4672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.086e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.096e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 SUPT5H-205ENST00000593727 493 ntTSL 37.65□□□□□ -1.186e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.346e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.376e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.436e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ZNF207-213ENST00000581531 3560 ntTSL 56.1□□□□□ -1.436e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.536e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ZNF207-209ENST00000579416 396 ntTSL 24.72□□□□□ -1.656e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ZNF207-215ENST00000582705 333 ntTSL 23.27□□□□□ -1.896e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 XIAP-204ENST00000430625 528 ntTSL 33.23□□□□□ -1.896e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.261e-8■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 PTBP1-210ENST00000586944 4661 ntTSL 217.6■□□□□ 0.415e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.161e-12■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.371e-12■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.074e-6■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 DGCR8-202ENST00000383024 4419 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.384e-6■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 PRKCSH-208ENST00000589126 625 ntTSL 514.99□□□□□ -0.013e-9■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 PRKCSH-218ENST00000593053 588 ntTSL 514.54□□□□□ -0.081e-6■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 PRKCSH-206ENST00000587509 545 ntTSL 413.08□□□□□ -0.321e-6■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 PRKCSH-207ENST00000588269 557 ntTSL 513.08□□□□□ -0.321e-6■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 PRKCSH-220ENST00000593104 545 ntTSL 412.38□□□□□ -0.431e-6■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 PRKCSH-214ENST00000591946 569 ntTSL 25.13□□□□□ -1.591e-6■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.328e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.572e-28■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.44e-19■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.394e-19■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 HK1-202ENST00000359426 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.592e-6■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 HK1-201ENST00000298649 3596 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.622e-6■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 HK1-206ENST00000448642 3868 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.772e-6■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 HK1-203ENST00000360289 3961 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.022e-6■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 DNM2-213ENST00000589106 565 ntTSL 210.82□□□□□ -0.681e-10■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.159e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 SQLE-205ENST00000521232 711 ntTSL 318.98■□□□□ 0.639e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.259e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -07e-10■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-203ENST00000470714 868 ntTSL 318.67■□□□□ 0.585e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-205ENST00000483329 819 ntTSL 513.53□□□□□ -0.245e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 CTSD-203ENST00000429746 690 ntTSL 319.27■□□□□ 0.685e-12■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.939e-24■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 LAMB2-208ENST00000477701 559 ntTSL 215.17■□□□□ 0.021e-7■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 CXCL16-205ENST00000576153 1484 ntTSL 210.35□□□□□ -0.759e-24■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.11e-6■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.788e-6■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 HMG20B-213ENST00000488973 2434 ntTSL 1 (best)19.57■□□□□ 0.728e-6■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.452e-6■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.312e-6■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.494e-7■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 PRRC2B-208ENST00000465931 5366 ntTSL 212.84□□□□□ -0.355e-9■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 PRRC2B-201ENST00000320547 4950 ntTSL 212.58□□□□□ -0.45e-9■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.558e-7■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.151e-6■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 VARS-221ENST00000463184 619 ntTSL 222.09■■□□□ 1.131e-6■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 TPM3-221ENST00000513769 539 ntTSL 310.8□□□□□ -0.688e-17■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 PSMB2-201ENST00000373237 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.465e-6■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 PABPC1-209ENST00000519100 851 ntTSL 34.61□□□□□ -1.671e-40■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.115e-15■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.535e-15■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.975e-15■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 PTTG1-204ENST00000519287 670 ntTSL 58.35□□□□□ -1.075e-15■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 CUL4B-205ENST00000467641 836 ntTSL 315.22■□□□□ 0.032e-9■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 CUL4B-201ENST00000336592 3109 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.052e-9■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.442e-9■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 CRKL-202ENST00000411769 2037 ntTSL 1 (best)20.48■□□□□ 0.872e-7■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.482e-7■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.276e-8■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 ATP6V1F-202ENST00000492758 711 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.416e-8■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 ALDOA-215ENST00000565355 538 ntTSL 517.24■□□□□ 0.359e-52■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 ALDOA-217ENST00000566130 801 ntTSL 215.65■□□□□ 0.19e-52■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.623e-7■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 GSN-207ENST00000432226 1042 ntTSL 519.27■□□□□ 0.681e-6■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 GSN-212ENST00000477863 716 ntTSL 417.6■□□□□ 0.411e-6■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 GSN-210ENST00000477104 806 ntTSL 416.93■□□□□ 0.31e-6■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 GSN-213ENST00000483960 802 ntTSL 312.5□□□□□ -0.411e-6■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 SLC6A8-209ENST00000476466 470 ntTSL 315.6■□□□□ 0.097e-12■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.618e-7■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.15e-38■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 SERPINA1-220ENST00000636712 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.155e-38■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 SERPINA1-203ENST00000393088 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.275e-38■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 SERPINA1-202ENST00000393087 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.385e-38■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 SERPINA1-210ENST00000489769 1562 ntTSL 1 (best)12.52□□□□□ -0.45e-38■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 SERPINA1-201ENST00000355814 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.835e-38■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 SERPINA1-207ENST00000440909 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.845e-38■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 SERPINA1-206ENST00000437397 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.895e-38■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 SERPINA1-208ENST00000448921 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.975e-38■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 A2M-211ENST00000543436 600 ntTSL 512.63□□□□□ -0.392e-76■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 EGFL7-206ENST00000492002 654 ntTSL 525.77■■□□□ 1.722e-8■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.153e-10■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 DPYSL2-201ENST00000311151 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.973e-10■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.143e-10■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.163e-10■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.821e-6■■□□□ 12.5
Retrieved 100 of 13,035 protein–RNA pairs in 77 ms