Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF4GQ14541 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HNF4GQ14541 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HNF4GQ14541 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms