Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CUL1Q13616 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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