Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LCP2Q13094 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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