Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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