Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms