Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP9P55211 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP9P55211 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CASP9P55211 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CASP9P55211 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
CASP9P55211 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CASP9P55211 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CASP9P55211 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms