Protein–RNA interactions for Protein: P49407

ARRB1, Beta-arrestin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRB1P49407 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARRB1P49407 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARRB1P49407 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms