Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME1P48163 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME1P48163 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ME1P48163 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ME1P48163 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ME1P48163 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ME1P48163 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ME1P48163 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ME1P48163 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ME1P48163 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME1P48163 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME1P48163 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME1P48163 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME1P48163 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME1P48163 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME1P48163 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME1P48163 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME1P48163 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME1P48163 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME1P48163 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME1P48163 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME1P48163 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME1P48163 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME1P48163 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME1P48163 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME1P48163 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME1P48163 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME1P48163 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME1P48163 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME1P48163 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME1P48163 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME1P48163 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME1P48163 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME1P48163 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME1P48163 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME1P48163 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME1P48163 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ME1P48163 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME1P48163 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME1P48163 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME1P48163 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME1P48163 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME1P48163 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms