Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM6P40199 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms