Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms