Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GCSHP23434 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GCSHP23434 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GCSHP23434 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GCSHP23434 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCSHP23434 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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