Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CXCL3P19876 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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