Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD3O95983 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD3O95983 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD3O95983 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD3O95983 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD3O95983 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD3O95983 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD3O95983 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD3O95983 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD3O95983 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD3O95983 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD3O95983 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD3O95983 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD3O95983 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD3O95983 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD3O95983 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD3O95983 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD3O95983 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD3O95983 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD3O95983 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD3O95983 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD3O95983 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD3O95983 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD3O95983 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD3O95983 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD3O95983 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms