Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GMDSO60547 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GMDSO60547 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GMDSO60547 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GMDSO60547 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GMDSO60547 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GMDSO60547 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GMDSO60547 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GMDSO60547 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GMDSO60547 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GMDSO60547 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GMDSO60547 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GMDSO60547 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GMDSO60547 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GMDSO60547 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GMDSO60547 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GMDSO60547 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GMDSO60547 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GMDSO60547 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GMDSO60547 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GMDSO60547 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GMDSO60547 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GMDSO60547 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GMDSO60547 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GMDSO60547 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GMDSO60547 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GMDSO60547 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GMDSO60547 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GMDSO60547 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GMDSO60547 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GMDSO60547 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GMDSO60547 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GMDSO60547 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GMDSO60547 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GMDSO60547 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GMDSO60547 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms