Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms