Protein–RNA interactions for Protein: O14836

TNFRSF13B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13BO14836 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF13BO14836 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms