Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms