Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNPKQ9C0E8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms