Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHP1Q99653 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms