Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms