Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPTSSAQ969W0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms