Protein–RNA interactions for Protein: Q66K66

TMEM198, Transmembrane protein 198, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM198Q66K66 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM198Q66K66 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms