Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1DP3Q658K8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EEF1DP3Q658K8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms