Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms