Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTRK3Q16288 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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