Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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