Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAPQ14761 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms