Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIGQ13278 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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RIGQ13278 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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RIGQ13278 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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RIGQ13278 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIGQ13278 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIGQ13278 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIGQ13278 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIGQ13278 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIGQ13278 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIGQ13278 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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