Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms