Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms