Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNCP24821 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNCP24821 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNCP24821 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNCP24821 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNCP24821 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms