Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR2C1P13056 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms