Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms