Protein–RNA interactions for Protein: O76071

CIAO1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIAO1O76071 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CIAO1O76071 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms