Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRODHO43272 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRODHO43272 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRODHO43272 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRODHO43272 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRODHO43272 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRODHO43272 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRODHO43272 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRODHO43272 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRODHO43272 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PRODHO43272 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRODHO43272 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRODHO43272 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRODHO43272 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms