Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR3KQ9Y2Y1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms