Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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TPCN1Q9ULQ1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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TPCN1Q9ULQ1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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TPCN1Q9ULQ1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22■■□□□ 1.11
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TPCN1Q9ULQ1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
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TPCN1Q9ULQ1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
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TPCN1Q9ULQ1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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TPCN1Q9ULQ1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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TPCN1Q9ULQ1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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TPCN1Q9ULQ1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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TPCN1Q9ULQ1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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TPCN1Q9ULQ1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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TPCN1Q9ULQ1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
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