Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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