Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP44Q9H0E7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms