Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms