Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGAP6Q5VW22 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms