Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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