Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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