Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms