Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK4P51957 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK4P51957 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK4P51957 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK4P51957 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK4P51957 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK4P51957 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK4P51957 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK4P51957 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK4P51957 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK4P51957 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK4P51957 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK4P51957 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK4P51957 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK4P51957 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK4P51957 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK4P51957 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK4P51957 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK4P51957 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK4P51957 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK4P51957 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEK4P51957 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NEK4P51957 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEK4P51957 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEK4P51957 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEK4P51957 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEK4P51957 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms