Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTSSP25774 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTSSP25774 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTSSP25774 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTSSP25774 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTSSP25774 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTSSP25774 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTSSP25774 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTSSP25774 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTSSP25774 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms