Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEFMP07197 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NEFMP07197 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFMP07197 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFMP07197 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFMP07197 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFMP07197 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFMP07197 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFMP07197 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFMP07197 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFMP07197 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFMP07197 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFMP07197 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFMP07197 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFMP07197 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFMP07197 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFMP07197 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFMP07197 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFMP07197 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEFMP07197 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFMP07197 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFMP07197 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFMP07197 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFMP07197 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFMP07197 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms