Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM37O94972 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms