Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DTNBO60941 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTNBO60941 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DTNBO60941 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTNBO60941 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTNBO60941 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTNBO60941 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTNBO60941 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTNBO60941 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DTNBO60941 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DTNBO60941 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTNBO60941 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTNBO60941 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DTNBO60941 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTNBO60941 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms